这个单词 消毒 是指从某个表面或仪器中根除微生物的过程。在医学上，这个词也被用来指代人类和动物为影响生育而进行的手术，构成一种永久性的避孕方法。
灭菌在其根除微生物的意义上进行，其目的是为各种程序或外科手术准备表面、器械甚至身体区域。其目的是防止细菌在组织中定殖，从而引起感染。
过去，很大一部分接受手术或受伤的患者死于感染，如今，由于采用了绝育程序，这种风险已降至最低。
从区域、表面、医疗家具、设备和仪器中根除细菌通常使用消毒剂产品进行化学处理，也使用热和气体等物理手段，对于后者，使用称为高压灭菌器的设备。这些过程是根据保证其质量的标准化协议进行的。
身体表面的消毒是通过化学方法进行的，在手术或程序之前，必须进行细菌的根除，这被称为 防腐，一旦微生物被根除，就必须保持卫生条件，避免污染，后者构成 无菌.
皮肤和粘膜是由构成它们通常菌群的多种细菌定殖的表面。当生物体内部有一扇门时，这些细菌定殖于没有保护自己免受它们侵害的机制的组织中，因此起源感染过程。这在皮肤上发现的主要细菌中很常见，称为葡萄球菌（金黄色葡萄球菌)，当有割伤或皮肤有入口时（如静脉线患者或使用注射器的吸毒者），这种微生物能够进入体内并定植于骨骼、关节和内脏器官，导致严重的感染，在某些情况下可能是致命的。
当手术室、设备或手术器械等区域因灭菌过程失败而受到污染时，另一组能够引起感染的病菌可以到达组织，从而引起所谓的院内感染，其中一组特殊的微生物如 假单胞菌, 变形杆菌, 克雷伯氏菌 和肠杆菌科细菌具有两个值得高度关注的特征，例如它们对大量抗生素具有很强的抵抗力和高死亡率，特别是当感染影响老年人、幼儿、慢性病患者和免疫功能低下患者时。
与细菌耐药性发展相关的因素之一是抗生素的滥用和误用，这一方面值得医生和患者深刻反思和改变行为。
